古属夷地。
春秋时,属鲁国。
战国时,归齐国。
秦时,属琅琊郡。
西汉时,属东武县。
隋后,属诸城县。
清时,置枳沟练。
民国12年(1923)1912年后,属第三;1945年,置枳沟;1947年4月,划归莒北县。
1950年1月,复归诸城县,1951年更名为第六。
1955年4月,复为枳沟。
1958年2月,改置枳沟乡。
1958年9月,属先进公社,1959年先进公社更名为吕标公社。
1976年3月,改置枳沟公社。
1984年4月,改置枳沟镇,至今。